Ce projet nécessite d'avoir assimilé l'ensemble des notions du second module du cours de Science des Données biologiques 2. Il correspond au dépôt GitHub https://github.com/BioDataScience-Course/B02Ia_abalone. Il est distribué sous licence CC BY-NC-SA 4.0.
Ce projet est individuel, court et cadré. Vous devrez :
- visualiser et décrire des données
- ajuster et décrire un modèle linéaire simple
- déterminer l'équation du modèle
- utiliser l'analyse des résidus pour vérifier si le modèle est pertinent
- Complétez le fichier
R/import_abalone.Rafin d'obtenir le tableau de données à étudier.
Un tableau comprenant les métadonnées correspondantes est repris ci-dessous
| Nom de la variable | Label. | Unité |
|---|---|---|
| sex | Sexe | NA |
| length | Longueur de coquille | mm |
| diameter | Largeur de coquille | mm |
| height | Épaisseur totale | mm |
| whole_weight | Masse totale | g |
| shucked_weight | Masse des tissus mous | g |
| viscera_weight | Masse des viscères | g |
| shell_weight | Masse de la coquille | g |
| rings | Anneaux de croissance | NA |
| age | Age | années |
-
Complétez les zones manquantes dans le carnet de notes
abalone_notebook.qmd. -
Assurez-vous à la fin que vous pouvez compiler une version HTML du fichier
abalone_notebook.qmd(bouton 'Rendu') sans erreurs. Sinon, corrigez-les avant soumission finale. N'utilisez pas l'argumentecho=FALSEdans vos chunks. Le code R qui génère les résultats doit rester visible dans la version HTML finale. -
Utilisez les outils de vérification mis à votre disposition (onglet 'Construire' -> bouton 'Construire tout').
-
Enfin, vérifiez que votre dernier commit + push est bien enregistré sur GitHub à la fin de l'exercice.
Dans le cadre de votre travail, vous pouvez utiliser l’intelligence artificielle. Il est toutefois impératif de préciser, dans la section « Matériel et méthodes » du projet, que l’IA a été utilisée, en indiquant le contexte et la manière dont elle a été employée. Voici un exemple de formulation :
La relecture (orthographe et syntaxe) a été réalisée à l’aide de Microsoft Copilot (basé sur GPT-5), consulté le 12 janvier 2026.
Attention, vous devez néanmoins employer le dialecte SciViews-R afin de garantir votre compréhension du cours de Science des données biologiques 2 lors de la production de code R dans votre projet.
Un chatbot SciViews est également disponible dans RStudio (Saturn Cloud), via l’addin Help. Il répond aux questions relatives au langage R, aux statistiques et à la science des données.